【BDTC先睹为快】国防科大彭绍亮：天河超级计算机上的生物医药大数据研究

2015中国大数据技术大会

BDTC 2015将为期三天，在大会主会之外，拟设立16个分论坛，包括数据库、深度学习、推荐系统、安全等6大技术论坛，金融、制造业、交通旅游、互联网、医疗健康、教育、网络通讯等7大应用论坛，以及政策法规和标准化、数据市场及交易、社会治理等3大热点议题论坛，将邀请近100位国外大数据技术领域顶尖专家与一线实践者，深入讨论Spark、Kudu、PostgreSQL、YARN、HBase、机器学习/深度学习、推荐系统等热门技术及行业实践。

目前，天河系列超级计算机已经在天津、长沙、广州等多个城市和国家超算中心进行了部署，并且在基因工程、药物设计等领域发挥着越来越大的作用。随着高性能计算技术在商业领域的普及应用，以及大数据分析技术和工具的出现，生物医药行业迎来了更为广阔、更具想象力的成长空间。本次大会请到了国防科技大学博士研究员彭绍亮，他将为我们带来《天河超级计算机上的生物医药大数据研究》的主题演讲，本文是ImapBox对彭绍亮的会前采访。

彭绍亮

博士，研究员，2008年至今在国防科技大学计算机学院从事高性能计算、大数据、生物医学工程、移动计算等技术研究工作，并担任天河生命科学计算方向负责人，华大基因研究院 “特聘教授”。2008年获国防科技大学计算机学院博士学位，2007年至2008年在香港城市大学计算机系联合培养。曾经主持国家自然科学基金项目3项(重点1项)，国家发改委项目1项，省部级项目3项，并以第一作者身份出版学术专著一部（“十一五”国家重点图书）。已经发表学术论文数十篇，其中包括Nature Communication, Genome Biology,  BMC Bioinformatics, PLOS ONE, ACM/IEEE Transactions, ISC, 《中国科学》等。曾参与天河系列超级计算机应用软件研发工作，参与国家973项目、863项目、军队重大型号项目等13项，获军队科技进步一等奖1项。是中国计算机学会理事(2016-2019)，高性能计算、大数据、传感器网络专委会委员、CCF高级会员、YOCSEF长沙2015-2016副主席、中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会委员、ACM/IEEE会员，担任Bioinformatics、TPDS、INFOCOM、JCST、《计算机学报》、《计算机研究与发展》等会议和期刊的审稿人，在国际、国内多个程序委员会担任主席、委员等职（如：PADS联合主席, IPDPS, CWSN-2012, WASA 2013, ICCCN等会议的程序委员会委员）。目前申请软件著作权15项，专利11项。

ImapBox：能介绍下目前您的研究方向吗？

彭绍亮：目前的研究方向是高性能计算/大数据/生物医药大数据/移动计算。

ImapBox：在您的研究项目中用到哪些大数据技术？您对这些技术满意的地方和不满意的地方分别有什么?

彭绍亮：“大数据技术”这种提法个人觉得很有意思，是不是只要能用来解决大数据问题的信息技术应该都可以称作“大数据技术”？包括硬件和软件技术,包括高性能计算和分布式计算等。天河超级计算机在设计时就不仅考虑了科学工程计算，还考虑了对大数据应用的支持。

ImapBox：能否谈谈大数据在您的行业落地目前主要遇到哪些挑战？

彭绍亮：生物医药大数据领域很早就数据膨胀了，而且数据产生速度越来越快，成本越来越低，对数据处理的时效性要求越来越高，问题复杂多样，各种挑战也越来越多（计算、通信、存储等）。

ImapBox：大数据领域的新技术发展很快，从整个大数据产业来说，您认为哪些技术趋势值得关注？

彭绍亮：高性能计算、云计算甚至移动计算等技术都值得关注。

ImapBox：针对您所在的行业，哪些技术是您目前主要观察和研究的，您为什么看好这些技术？

彭绍亮：针对生物医药大数据领域，我们以应用牵引技术发展，生物医药应用问题的多态性会带来技术的多态性，无论高性能计算或分布式计算都要以解决实际大数据应用问题为目标，我们主要关注高性能计算领域的系列新技术。

ImapBox：前不久，天河二号创造超算领域新的世界纪录，你认为天河的再次夺冠会给您所在的领域带来哪些影响？

彭绍亮：天河二号六连冠希望能够进一步加速我国生物医药大数据领域的发展和进步。国防科技大学计算机学院天河团队希望能在生物医药大数据等应用领域和国际国内的更多企事业、高校和科研院所的专家、老师建立合作关系，助力生物医药大数据领域的发展。

ImapBox：请谈谈您在这次大会上即将分享的话题。

彭绍亮：《天河超级计算机上的生物医药大数据研究》：天河系列超级计算机已经在天津、长沙、广州等多个城市和国家超算中心进行了部署，并且在基因工程、药物设计等领域发挥着越来越大的作用。随着高性能计算技术在商业领域的普及应用，以及大数据分析技术和工具的出现，生物医药行业迎来了更为广阔、更具想象力的成长空间。希望天河超级计算机和天河团队能持续加速生物医药大数据的分析和计算过程，助力整个生命科学领域的发展。

ImapBox：哪些听众最应该了解这些话题？您所分享的主题可以帮助听众解决哪些问题？

彭绍亮：生物医药和信息技术领域的相关专家、学者、学生和企业从业人员都欢迎参加和了解这些话题，希望高性能计算技术和天河超级计算机能持续加速生物医药大数据的分析和计算过程，助力整个生命科学领域的发展。

ImapBox：能否谈谈您对BDTC2015、其他的讲师分享的话题有什么期待？

彭绍亮：BDTC2015希望能看到更多新面孔和新技术，希望不同领域的朋友们可以多合作和交流，碰撞出新的火花。